في 26 نوفمبر 2016، أثناء عمله كمعلق رياضي على قناة FM 104 ، تحدث أحمد جودة عن الاحتجاجات الجارية في البلاد في ذلك الوقت بسبب ارتفاع أسعار الأدوية. وفي اليوم نفسه، قام جهاز الأمن والمخابرات الوطني السوداني بالقبض على جودة واحتجازه لأكثر من 40 يومًا. بعد الإفراج عنه، صدر في حقه قرار بالمنع من السفر لمدة عام وأدرج اسمه في القائمة السوداء لمنعه من العمل كصحفي في السودان.

في 12 مايو 2018 ، تم اعتقال جودة مرة أخرى من منزله في أم درمان من قبل جهاز الأمن والمخابرات الوطني السوداني واحتجز في مقره للاستجواب لمدة 16 ساعة، ثم أطلق سراحه في نفس اليوم.

في 16 يوليو / تموز 2018، أُعيد اعتقال جودة في منزله في أم درمان من قبل جهاز الأمن والمخابرات الوطني السوداني، ونقل إلى مكان احتجاز سري. وظل مختفيا قسريا ً لأكثر من شهرين ، احتُجز خلالها لمدة 45 يوماً في مركز احتجاز يقع في مكاتب جهاز الأمن والمخابرات الوطني السوداني في الخرطوم، و 19 يوماً في مركز احتجاز تابع لنفس الجهاز في سجن كوبر في الخرطوم. وأثناء احتجازه، دخل جودة في إضراب عن الطعام احتجاجا على حرمانه المتعمد من الرعاية الطبية وسوء ظروف الاحتجاز. أطلق سراحه في 18 سبتمبر 2018 دون أن توجه له أية تهمة.